父母双亡的红花百合子搬家到了父亲工作过的小镇,并在那里收到了父亲生前从『神之代』寄出的一封信,里面只有一张奇怪的黑白格子卡片。为了调查离奇去世的父亲的死因,百合子前往神之代并发现了一座气派却透露出不祥气息的黑色钟塔。隔日百合子向友人园町真弥与御叶紫询问起黑色钟塔,却发现对方闪烁其词,很快转移了话题。父亲的真正死因是什么？那张卡片究竟代表了什么？